首頁(yè) > 期刊 > 自然科學(xué)與工程技術(shù) > 基礎(chǔ)科學(xué) > 生物學(xué) > 西北植物學(xué)報(bào) > 茶樹(shù)種子發(fā)育過(guò)程的轉(zhuǎn)錄組分析 【正文】
摘要:該研究以‘鐵觀音’茶樹(shù)品種的種子為試驗(yàn)材料,采用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)分析種子發(fā)育的3個(gè)時(shí)期(幼果期、膨大期、成熟期)的表達(dá)差異,探究茶樹(shù)種子油脂代謝的分子機(jī)制。結(jié)果表明:(1)經(jīng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、組裝后共獲得30940581個(gè)clean reads,經(jīng)數(shù)據(jù)合并拼接最終得到36951條非冗余Unigene序列,其中28476個(gè)Unigene可得到功能注釋;在轉(zhuǎn)錄本中能夠被注釋到GO分類的Unigene有11201條(30.3%),KEGG分析發(fā)現(xiàn)共有17172個(gè)基因參與了127個(gè)代謝通路。(2)經(jīng)KEGG通路篩選出14條與脂肪酸代謝相關(guān)的通路,且隨著茶籽的發(fā)育,大部分脂肪酸調(diào)控途徑相關(guān)基因呈下調(diào)趨勢(shì),其中上調(diào)基因數(shù)最多的有α-亞麻酸代謝途徑和脂肪酸降解途徑(有17個(gè)基因表達(dá)量上調(diào)),下調(diào)基因數(shù)最多的是甘油磷脂代謝途徑(有58個(gè)基因表達(dá)量下調(diào));在茶籽發(fā)育幼果期α-亞麻酸代謝途徑中表達(dá)量上調(diào)的基因數(shù)超過(guò)表達(dá)量下調(diào)的基因數(shù)。(3)研究發(fā)現(xiàn)茶籽脂肪酸合成相關(guān)的基因涉及14個(gè)脂類調(diào)控途徑,共409條差異基因;隨著茶樹(shù)種子發(fā)育到成熟期,上調(diào)的差異表達(dá)基因數(shù)量在減少,下調(diào)的差異表達(dá)基因數(shù)量增加,其中α-亞麻酸途徑中的基因PLA2G16、DAD1、pldA、FabF、FabI表達(dá)量上調(diào)顯著,隨后表達(dá)量下調(diào)。(4)qRT-PCR檢測(cè)結(jié)果表明,7個(gè)茶樹(shù)FAD和1個(gè)ACP差異表達(dá)基因的水平與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果基本一致;隨著茶籽的發(fā)育,基因CsFAD7和Δ6-CsFAD從幼果期、果實(shí)膨大期至果實(shí)成熟期都為差異下調(diào)表達(dá),CsFAD2、CsFAD 6和Δ7-CsFAD為差異上調(diào)表達(dá),CsFAD 8、Δ8-CsFAD和CsACP在幼果期至果實(shí)膨大期差異上調(diào)表達(dá),在果實(shí)膨大期至果實(shí)成熟期差異下調(diào)表達(dá)。
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主管單位:陜西省科學(xué)院;主辦單位:陜西省科學(xué)院;西北農(nóng)林科技大學(xué);陜西省植物學(xué)會(huì)
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