首頁 > 期刊 > 自然科學(xué)與工程技術(shù) > 農(nóng)業(yè)科技 > 林業(yè) > 麥類作物學(xué)報 > 轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)在鑒定小麥染色體臂置換系染色體組成上的應(yīng)用 【正文】
摘要:為給染色體片段置換系的快速鑒定提供新的技術(shù)手段,用3個以普通小麥品種中國春(Chinese Spring,CS)為背景的野生二粒小麥(TTD140)染色體臂置換系(chromosome arm substitution line,CASL)進行轉(zhuǎn)錄組測序,并結(jié)合SNP分析,獲得純合的SNP,用于鑒定CASL材料中TTD140的置換區(qū)段。結(jié)果發(fā)現(xiàn),CASL3AL的SNP主要分布在染色體3A的108~750 Mb區(qū)段;CASL7BS的SNP分布于染色體7B的0~536 Mb和5A的22~482 Mb區(qū)段;CASL4AL的SNP分布比較復(fù)雜,除集中在4A的40~745 Mb、7B的0~570 Mb以及5B的410~675 Mb外,還在1A、2A、3A、7A、2B、2D、5D、6D和7D染色體上成簇分布,表明該材料除在預(yù)期的染色體4A上保留TTD140的大片段外,還在其他染色體上殘留許多TTD140小片段。通過97對多態(tài)性SSR標(biāo)記驗證CASL3AL的染色體組成,發(fā)現(xiàn)84對標(biāo)記能檢測到TTD帶型,其分布范圍與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)鑒定結(jié)果基本一致。對SNP富集區(qū)域的320 bp PCR產(chǎn)物直接測序,發(fā)現(xiàn)CASL3AL與CS之間存在7個SNP位點,但與TTD140以及Zavitan參考序列一致。因此,本研究利用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)能夠有效鑒定小麥染色體片段置換系材料的染色體組成,且比傳統(tǒng)的分子標(biāo)記技術(shù)準確、方便、快捷。
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主管單位:中華人民共和國教育部;主辦單位:西北農(nóng)林科技大學(xué);中國作物學(xué)會;國家小麥工程技術(shù)研究中心